Tento krajinný celek v severní části Slovenska se rozkládá mezi Belánskými Tatrami a údolím Popradu. Oblast sousedí na severovýchodě s Pieninami, na východě s Ľubovnianskou kotlinou, na jihu s Popradskou kotlinou, na jihozápadě se Skorušinskými vrchy a na západě a severozápadě tvoří státní hranici s Polskem.

Západní část masívu tvoří souvislý protáhlý hřbet. Ve východní části vystupuje několik kratších hřbetů, které se zbíhají u Riňavy (1005 m) a Větrného vrchu (1112 m). Vrchy Spišské Magury vytváří zvláštní reliéf zvaný kvesty.
Při obci Osturňa v severní části pohoří se nachází skupina tří jezer, Dankovo pleso leží ve výšce 874 m.n.m., Velké jezero ve výšce 820 m.n.m. a Malé jezero v 873 m.n.m. Všechna se vyznačují vzácnou mokřadní flórou. Spišská Magura patří do povodí Dunajce (severní část) a do povodí Popradu (jižní část). Nejvyšším vrcholem Spišské Magury je vrchol Repiska (1259 m.n.m.). Tento vrchol je na samé hranici masívu a přes sedlo Pod Príslopom se napojuje na Belánské Tatry.

Významným turistickým centrem Spišské Magury jsou lázně Vyšné Ružbachy. Ty leží na západním okraji stejnojmenné obce. „Kúpele“ vznikly při pramenech zemito uhličité vody jejíž teplota kolísá v rozmezí 21-24°C. První zprávy o pramenech pocházejí již z roku 1 635.